The film tells the story of Lucian (Michael Sheen), the first werewolf able to take human form and to be called a Lycan. Viktor (Bill Nighy), a ruthless elder vampire, raises the child. Viktor kills Lucian's werewolf mother but envisions a race of werewolf slaves for his clan that could keep guard during the day and toil for the vampires. As Lucian grows up, he and Viktor's young daughter Sonja (Rhona Mitra) develop an attraction that blossoms into love in their adult years, though they keep their relationship hidden.
Viktor has a relationship with the humans of the area; he protects them from the werewolves that roam the countryside in exchange for a tithe. As human nobles meet with the vampire council for protection from the werewolves, Sonja guards them. Lucian hears the werewolves near Sonja and orders Death Dealers sent to help her. When his orders are denied, he steals a horse and sword from a nearby Death Dealer. Werewolves proceed to kill the nobles, causing Lucian to battle them. When Lucian changes into a Lycan in order to protect Sonja, the werewolves back down. Viktor, despite acknowledging that Lucian saved his daughter, feels betrayed by his favorite pet and locks Lucian away after having him brutally whipped.
With the help of the scheming vampire Andreas Tanis, Sonja orchestrates Lucian's release in exchange for her seat on the vampire council. Lucian escapes, kills several of the vampires and begins liberating the other Lycans. The guards begin slaughtering the escapees. Sonja remains behind, but when Viktor discovers that she has had a forbidden relationship with Lucian, he imprisons her. Lucian and some of the freed Lycans roam the countryside recruiting many of the labourers of the human nobles to their fight for freedom. He also travels to a cavernous location that is teeming with werewolves, attempting to contact them. The vampire nobles are outraged by the escape and growing chaos, demanding that Viktor recapture Lucian. Viktor however, knows that Lucian will come to him.
Lucian learns about Sonja's imprisonment from one of her attendants and sets out to rescue her. Lucian orders his followers to wait, but be prepared to attack if he does not return. Lucian rescues Sonja from the fortress but they are attacked by the Death Dealers. Sonja confronts Viktor and tries to get him to call off his guards by revealing that she is pregnant with Lucian's child. Disgusted, Viktor overpowers her and imprisons both her and Lucian. Sonja is sentenced to death at a trial presided over by her father and the council. Lucian is forced to witness Sonja's death, in which she is burned to death by sunlight.
Lucian awakens when Viktor comes in to view his deceased daughter. As Viktor removes the pendant necklace he gave Sonja, an enraged Lucian transforms and overpowers Viktor. Lucian takes Sonja's pendant, escaping out a window. The escape is stopped at the castle walls by Death Dealers who shoot Lucian with crossbows. With a thunderous howl, Lucian summons the freed Lycans and werewolves, who attack the coven. Viktor sends Tanis to remove the slumbering Amelia and Markus from their crypts before joining the battle with his personal guard. The council, meanwhile are overwhelmed and butchered by the rampaging werewolves.
Italiano
La Ribellione dei Lycan narra delle origini della sanguinaria e secolare faida tra gli aristocratici vampiri e i loro schiavi di un tempo, i Lycan.
La storia inizia vent'anni dopo che William (figlio di Alexander Corvinus, morso da un lupo e diventando così il primo e il più feroce dei Lycan) diede origine a una razza di Licantropi incapaci di riprendere forma umana. Negli anni bui del primo Medioevo il re dei Vampiri, Viktor, scopre che un Licantropo femmina ha partorito per la prima volta un bambino umano anziché un piccolo Licantropo. Viktor, invece di ucciderlo, lo cresce e lo usa per i suoi scopi. Viktor intuisce subito che quel bambino non è altro che il primo Lycan capace di ritornare allo stadio umano e vuole usare il suo sangue per rendere gli altri Lycan più simili agli umani, quindi più docili e più facili da controllare. Il Lycan viene chiamato Lucian.Passano molti anni e Lucian diventa maniscalco della fortezza dei Vampiri. Egli si innamora della principessa Vampira, Sonja, figlia di Viktor (amore che viene ricambiato). Una notte stava arrivando al castello una carovana con dentro dei nobili, che dovevano essere accolti dalla corte. I nobili, infatti, vengono "protetti" dai Vampiri in cambio di schiavi umani e ingenti ricchezze. I Vampiri, pertanto, non si nutrono del loro sangue e li proteggono da altre creature sovrannaturali come i Licantropi. A prendere i nobili viene mandato un drappello di soldati capitanati da Sonja.
Nel frattempo Lucian, che ha l'olfatto sviluppatissimo essendo un mezzo lupo, capisce che i Licantropi stanno per attaccare la carovana in grandissimo numero. Allora ruba un cavallo e corre nella foresta per salvare la sua amata.
Quando capisce che i lupi sono troppi anche per lui, si toglie il collare che impediva la trasformazione grazie a una chiave costruita da lui e si trasforma in Lupo Mannaro. Con il suo ringhio riesce a comandare i lupi selvaggi, che quindi se ne vanno. Però i nobili (padre, madre e la loro figlia) vengono sbranati dai Lycan, così come molti degli schiavi umani che portavano in offerta ai Vampiri. In quel momento arriva un altro drappello che lancia frecce d'argento su Lucian per fermare la trasformazione. Lucian viene condannato a trenta frustate e a perdere tutti i suoi privilegi. Sonja prova a difenderlo invano. Viktor, che si era affezionato a Lucian, sente la sua ribellione come un'offesa personale nonché una minaccia, e non può perdonarlo.
Dopo le frustate Lucian viene condotto in prigione, dove aizza gli umani lì imprigionati alla ribellione. Questi umani nel frattempo sono stati morsi dai Lycan che lavorano alla fortezza per divenire Lycan in grado di tornare umani come Lucian. Aiutato da Sonja e da Tanis, lo storico dei vampiri,(vedi episodio precedente) che conosce la loro storia d'amore, riesce a scappare portandosi dietro un drappello di Lycan. Molti di questi però restano imprigionati. Lui e Sonja si dovrebbero vedere alla radura del fiume tre giorni dopo.
Viktor capisce che Lucian è fuggito grazie a Sonja e, mordendo la figlia, riesce a percepire i suoi ricordi. Vedendo i loro incontri inorridisce per il fatto che la figlia si sia accoppiata con un "animale" e la rinchiude nella sua camera per evitare che faccia follie per Lucian. Si sente tradito da lei e non la considera più nello stesso modo.